算的，只要引用部分出现在待检测论文中，查重系统就会对引用部分进行查重，并且计算文献部分的引用率，并自动标注在论文查重报告单中。用户在引用文献至论文中时，会设置正确的引用格式，在查重时，查重系统就会识别引用部分，并计算论文中引用部分的总字数与论文总字数的比值，最后标注在论文查重报告单中。